Il Museo di San Petronio fu aperto nel 1894 su progetto di Tito Azzolini e riunisce collezioni di particolare interesse: lavori di oreficeria, suppellettile sacra, graduali e antifonari miniati, edizioni musicali, oltre ai disegni e progetti architettonici per la facciata della Basilica di S. Petronio dovuti ad architetti famosi quali il Vignola, Domenico Tibaldi, Andrea Palladio, Francesco Terribilia, ecc...
